中国大陆柯萨奇病毒A组16型全基因参照序列的初步建立和分析

• 作者: 冯谦谨 江丽凤 郭中敏 陆家海 高风华
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A组16型 参照序列 序列比对
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 373-376
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

目的 建立中国大陆柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)流行株的全基因参照序列.方法 从GenBank中获得CoxA16中国大陆分离株的所有全基因序列和氨基酸序列,用DNAstar/MegAlign软件对所得序列进行多序列比对和进化分析,按照参照序列标准拟定CoxA16的全基因参照序列和氨基酸序列,并与参考序列进行比对分析.结果 中国大陆分离的CoxA16毒株全基因序列共8株,分离于2005-2009年,其中2008年5株,广东省5株；通过序列比对获得了大陆CoxA 16全基因和氨基酸参照序列；参考毒株间核苷酸序列同源性介于79.0％～98.8％,氨基酸序列同源性为94.3％～99.9％,与参照序列的核苷酸同源性为79.7％～97.0％,氨基酸同源性介于95.1％～99.5％之间,同源性最低的为2008年安徽阜阳的FY18株.结论 比对分析了中国大陆CoxA16毒株全序列,成功建立了中国大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭中敏	中山大学实验动物中心	57	251	9.0	13.0
2	高风华	中山大学公共卫生学院热带病防治研究教育部重点实验室广东省重大传染病预防和控制技术研究中心	3	25	2.0	3.0
3	江丽凤	中山大学公共卫生学院热带病防治研究教育部重点实验室广东省重大传染病预防和控制技术研究中心	16	52	5.0	6.0
4	冯谦谨	中山大学公共卫生学院热带病防治研究教育部重点实验室广东省重大传染病预防和控制技术研究中心	2	8	1.0	2.0