黑曲霉EIM-6pelA基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴毕莎 杨欣伟 柯崇榕 陈林 陈荣珠 黄建忠
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑曲霉 pelA基因 果胶裂解酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 186-190
• 分类号: Q78|Q811.4
• 字数: 3153字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2012.02.009

摘要

目的:克隆黑曲霉EIM-6果胺裂解酶A基因pelA,用于分析果胶裂解酶A的功能与结构.方法与结果:根据GenBank上黑曲霉pelA保守序列设计引物,采用RT-PCR获得黑曲霉EIM-6 pelA基因；序列分析表明,pelA基因具有4个内含子,开放读框为1140 bp,编码379个氨基酸残基,含有由20个氨基酸残基构成的信号肽序列；生物信息学分析表明,果胶裂解酶A为具有一定亲水性的稳定酸性分泌蛋白,具有明显的跨膜结构域,B片层结构是该蛋白的主体结构,空间结构是由反平行的B片层结构为基础包围组成的大环,保守功能区域为Pec_lyase_C结构域.结论:克隆获得黑曲霉EIM-6 pelA基因,并进行了生物信息学分析,为蛋白质工程改造果胶裂解酶A奠定了基础.