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萧氏松茎象线粒体基因组全序列测定与分析
萧氏松茎象线粒体基因组全序列测定与分析
作者:
尚娜
李国宏
魏建荣
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鞘翅目
象甲总科
萧氏松茎象
线粒体基因组
长距PCR
引物步移法
摘要:
象甲是鞘翅目中物种最丰富的类群,目前关于其线粒体基因组全序列的研究还未见报道.本研究利用长距PCR和引物步移法对萧氏松茎象Hylobitelus xiaoi Zhang线粒体基因组全序列进行了测定.结果显示:萧氏松茎象线粒体基因组序列全长16 123 bp(GenBank登录号为JX847496),共编码37个基因和1个非编码的控制区,基因次序与典型的六足动物线粒体基因排列一致,未发现基因重排现象.在基因组中两个值得注意的发现分别是:1)N链上存在1个额外的trnV-like序列,反密码子为GAC,长度为69 bp,其中65 bp与J链上的trnD重叠;2)trnSUCN和nad1之间存在1个长度为232 bp的基因间隔区.全部13个蛋白质编码基因的起始密码子均为ATN,9个蛋白质编码基因的终止密码子为TAA,其余4个蛋白质编码基因中,nad1和cox2的终止密码子为TAG,nad4和nad5则以不完整的终止密码子T作为终止信号.除trnSAGN外,其余的tRNAs均可形成典型的三叶草结构.而trnSAGN的反密码子由TCT替代GCT,反密码子臂延长形成9 bp(中间含1个碱基突起),TψC臂由正常的5 bp变为6 bp,DHU臂缩短仅1 bp,各个臂之间没有连接碱基.线粒体控制区中包括10处长度不少于5 bp的poly-T(最长poly-T长度为14 bp)和2处微卫星样重复序列(TA)6和(TA)9.本研究结果为探讨象甲总科在鞘翅目中的系统学地位及其与其他总科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据.
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发生
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萧氏松茎象
湿地松林
种间联结
内容分析
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文献信息
篇名
萧氏松茎象线粒体基因组全序列测定与分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
鞘翅目
象甲总科
萧氏松茎象
线粒体基因组
长距PCR
引物步移法
年,卷(期)
2012,(11)
所属期刊栏目
进化与系统学
研究方向
页码范围
1306-1314
页数
分类号
Q969
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李国宏
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室
9
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5.0
9.0
2
魏建荣
河北大学生命科学学院
22
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7.0
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昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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