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摘要:
为揭示SigL及其增强子结合蛋白(EBPs)在苏云金芽胞杆菌(Bt)中的调控功能,在全基因组测序的基础上,采用生物信息学方法,对YBT-1520菌株的SigL及其EBPs的结构和功能进行深入分析.结果表明,YBT-1520基因组中存在1个SigL和6个EBPs,而且EBPs在结构上具有丰富的多样性,包含了EBPs的所有可能的结构域组织类型.SigL所调控的基因涉及11个假定的COG代谢途径,其中包括能量代谢、氨基酸代谢、翻译与细胞周期等.根据EBPs在基因组的位置推测,YBT-1520的EBPs参与y-氨基丁酸代谢途径、精氨酸代谢途径、支链脂肪酸降解途径、多糖分解代谢等代谢途径的调控.本研究将为揭示Bt杀虫晶体蛋白大量表达的调控机制提供新的思路.
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文献信息
篇名 苏云金芽胞杆菌YBT-1520中SigL及其增强子结合蛋白的结构与功能分析
来源期刊 应用与环境生物学报 学科 农学
关键词 苏云金芽胞杆菌 增强子结合蛋白 SigL 代谢途径 功能分析 生物信息学 表达调控
年,卷(期) 2012,(2) 所属期刊栏目 简报
研究方向 页码范围 315-319
页数 5页 分类号 Q936|S476.11
字数 语种 中文
DOI 10.3724/SP.J.1145.2012.00315
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 喻子牛 134 1829 21.0 35.0
2 王阶平 8 25 3.0 5.0
3 何进 31 223 9.0 13.0
4 王丽丽 2 10 1.0 2.0
5 艾绪露 1 0 0.0 0.0
6 周航 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
苏云金芽胞杆菌
增强子结合蛋白
SigL
代谢途径
功能分析
生物信息学
表达调控
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
应用与环境生物学报
双月刊
1006-687X
51-1482/Q
大16开
成都市人民南路4段9号
62-15
1995
chi
出版文献量(篇)
3881
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7
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