鲢长江群体与国外移居群体间遗传变异的主要组织相容性复合体分析

• 作者: 冯维 刘至治 唐文乔 李思发 李雪松 杨金权
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲢 遗传变异 主要组织相容性复合体 移居群体
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 684-692
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

利用MHCⅠ类α2结构域基因片段,分析鲢长江群体（YZL）与多瑙河群体（DAN）、密西西比河群体（MIS）间的遗传变异。从3群体共40尾个体的117个有效克隆中,获得MHCⅠ类α2结构域等位基因68个。主要结果为：（1）YZL、DAN和MIS群体的等位基因数分别为21、27和20个,且群体间核苷酸序列（54.1%～99.5%）、氨基酸序列（39.4%～98.6%）的同源性变异范围大,揭示3群体MHCⅠ类α2结构域的多态性都较丰富。（2）群体内平均核苷酸/氨基酸序列同源性的大小顺序为MIS〉DAN〉YZL;而群体内核苷酸/氨基酸多样性指数（π/πaa）的大小顺序恰与此相反,表明鲢YZL群体MHCⅠ类α2结构域的变异较DAN和MIS群体大。（3）以氨基酸序列进行AMOVA分析的结果表明,3群体间、国内群体与国外移居群体间都存在显著的遗传分化（P〈0.05）。（4）3群体抗原结合区（PBR）的非同义碱基/同义碱基替换值ω的大小顺序为YZL（1.652 5）〉MIS（1.499 5）〉DAN（1.337 0）〉1,且在PBR区检测到5个正向选择位点,揭示3群体鲢MHCⅠ类分子均受到正向选择压力的作用,其中YZL群体的选择压力最大。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李思发	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	58	725	17.0	22.0
2	唐文乔	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	65	364	10.0	16.0
3	李雪松	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	5	53	4.0	5.0
4	刘至治	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
5	冯维	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	26	2.0	2.0