广西猪瘟病毒E2基因克隆及序列分析

• 作者: 刘欢 刘磊 刘芳 卢冰霞 张民秀 王艺 肖雄 郭旋 陆增荣 黄伟坚 黄福标 黎木兰
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪瘟病毒 E2基因 序列分析 同源性 氨基酸变异 广西
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 528-531
• 分类号: S858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2012.04.528

摘要

[目的]了解广西猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的变异规律及其与疫苗株的基因差异,为正确选择猪瘟疫苗和防制广西猪瘟提供参考依据.[方法]以广西本地的阳性猪瘟病料为研究对象,应用RT-PCR扩增CSFV的E2基因,经克隆、测序后用DNASTAR软件对其序列进行比对分析,并绘制遗传进化树.[结果]从41份疑似猪瘟病料中共扩增出4个阳性样品的E2基因(1140 bp),经序列比对分析发现,扩增获得的4株CSFV毒株(GXGG1、GXLC1、GXLC2和GXNN1)与兔化弱毒株(HCLV)、Shimen强毒株的核苷酸同源性为82.1％～82.3％和82.9％～83.4％、其推导氨基酸同源性为88.4％～89.2％和88.9％～90.0％,4株毒株间的E2基因核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为90.8％～99.6％和94.2％～99.5％,且均属于基因群Ⅱ；E2基因推导的氨基酸表明,E2蛋白空间结构及抗原结构的氨基酸位点693Cys、737Cys、792Cys、818Cys、828Cys、856Cys、833Pro、834Thr、837Arg均未发生变异,但其单抗识别位点G713E、N729D、K734R发生变异.[结论]近年来广西CSFV流行毒株的变异未出现较大差异.与HCLV株、Shimen强毒株亲缘关系较远,但与Paderborn株、GXWZ02株亲缘关系较近.