中国乙型肝炎病毒流行株的适应性进化分析

• 作者: 刘俊 张朝 徐庆刚 黄艳
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 B型 C型 正选择 T细胞抗原表位 耐药
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 312-319,323
• 分类号: R373.21
• 字数: 6741字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7783.2012.04.009

摘要

目的:检测中国乙型肝炎病毒(HBV)B型和C型4个基因(区)(S、C、X和RT)的正选择位点,推断近年来中国HBV的变异趋势和原因.方法:从基因库下载中国所有B型和C型全长序列共864条,参照标准序列分别截取S、C、X和RT 4个基因(区),使用HyPhy方法筛选各基因序列集的正选择位点并进行统计和分析.结果:共检测到226个正选择位点(B型101个,C型125个),其中85个位点(B型37个,C型48个)分别位于75个(B型32个,C型43个)抗原表位上,表明正选择的发生与病毒的免疫逃逸相关.值得注意的是,B型RT区的3个耐药位点180、181和223,和C型RT区的4个耐药位点173、180、181和223,也被检测到受到正选择压力,表明正选择发生与耐药发生相关.结论:中国地区HBV B型和C型的RT区受到的选择压力与耐药突变存在潜在联系,其他区域的正选择与病毒的逃逸机制密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐庆刚	江苏大学生命科学研究院	18	79	6.0	8.0
2	刘俊	江苏大学生命科学研究院	42	234	9.0	13.0
3	黄艳	江苏大学生命科学研究院	2	4	1.0	2.0
4	张朝	江苏大学生命科学研究院	1	1	1.0	1.0