蜜蜂表皮蛋白apidermin(apd)基因家族3个新成员的特性鉴定及昆虫APD家族序列特征的分析

• 作者: 孙亮先 葛清秀 郑华军 陈怀宇 黄周英 龚丽萍
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 西方蜜蜂 东方蜜蜂 表皮蛋白 apidermin基因 APD家族 序列分析 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 12-23
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

Apidermin (APD)蛋白家族是一个新的昆虫结构性表皮蛋白家族.本研究结合生物信息学和RT-PCR扩增,对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称“意蜂”)的apd-1-like,apd-3 -like和中华蜜蜂Apis cerena cerena(简称“中蜂”)的apd-2等3个新的apd基因的结构特征和表达进行了分析,并分析了昆虫APD蛋白家族的序列特征.结果显示,在西方蜜蜂Apis mellifera(简称“西蜂”)中,apd基因家族的6个成员串联排列在基因组序列第4号连锁群上,它们在A.m.ligustica雄蜂头部中的转录水平差异明显,且其启动子序列所含顺式元件也不同.中蜂apd-2和意蜂apd-1 -like都含有3个外显子和2个内含子,而意蜂apd-3-like则由4个外显子和3个内含子组成.蛋白序列分析结果显示,目前已知的10条APD蛋白序列N末端均具有相似的信号肽序列,其成熟蛋白分子量为6.0～37.0 kD,pI为6.2～10.8.其中西蜂的APD l -3、APD-like和东方蜜蜂Apis cerena的APD-2等5条较短的多肽中疏水氨基酸残基达52％～67％,且Ala含量最为丰富(占25％ ～ 34％)；而丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis的APD 1 -3和西蜂APD-1-like,APD-3-like等另外5条APD多肽富含Gly(21％ ～30％),其序列中疏水氨基酸残基含量为35％ ～41％.多肽序列多重比对和系统进化分析结果显示,APD家族可划分为2个亚家族.亚家族Ⅰ含有西蜂APD 1 -3和东方蜜蜂APD-2等4条较短的多肽序列,其N末端为一个长33 aa的保守基序；亚家族Ⅱ由另外6条相对较长的多肽序列组成,其N末端保守基序长50 aa,C末端保守基序长16 aa.本文所描述的APD蛋白家族序列特征有助于以后从其他昆虫中鉴定新的apd基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙亮先	泉州师范学院福建省高校分子生物学与药物化学重点实验室	41	278	9.0	14.0
2	黄周英	泉州师范学院福建省高校分子生物学与药物化学重点实验室	36	315	10.0	16.0
3	葛清秀	泉州师范学院福建省高校分子生物学与药物化学重点实验室	25	184	7.0	12.0
4	郑华军		4	14	2.0	3.0
5	龚丽萍	泉州师范学院福建省高校分子生物学与药物化学重点实验室	1	7	1.0	1.0