栉孔扇贝消化盲囊细菌群落组成的季节变化分析

• 作者: 张婧宇 李赟 杨彩霞 王崇明
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 栉孔扇贝 消化盲囊 细菌群落 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 页码范围: 1579-1584
• 分类号: Q938.8|S966.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.28037

摘要

为分析栉孔扇贝消化盲囊内细菌群落组成及其季节变化,于2009年6月—2010年6月(2月份除外)定期从青岛沙子口流清河湾扇贝养殖海区采集养殖的2龄栉孔扇贝,采用SDS方法提取消化盲囊的总DNA,并通过引物358f和907r采用PCR扩增细菌16S rDNA的V3～V5区序列,利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)分离所得扩增序列.DGGE图谱显示,12个月份的样品共有不同位置的谱带11条,其中9条谱带作为共有谱带在所有月份的栉孔扇贝消化盲囊中均有分布,占总谱带数的81.82％,表明整个养殖季节栉孔扇贝消化盲囊内的细菌群落组成相对稳定.对11条DGGE条带进行切胶回收、PCR扩增、纯化、克隆后测序,其中9条谱带克隆测序成功.经BLAST比对搜索,结果显示9条序列与NCBI数据库中的序列相似性达97％～99％,所代表的细菌分别属于4大类群,变形菌门( Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)；NCBI数据库中与其相近的细菌主要为马赛菌属(Massilia)、芽孢杆菌属(Bacillus)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、聚球藻属(Synechococcus)、红球菌属(Rhodococcus)和未培养菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赟	中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室	48	532	14.0	20.0
2	王崇明	中国水产科学研究院黄海水产研究所	30	428	12.0	20.0
3	杨彩霞	中国水产科学研究院黄海水产研究所	2	8	1.0	2.0
7	张婧宇	中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室	2	15	2.0	2.0