TMV侵染烟草基因差异表达的cDNA-AFLP分析

• 作者: 万秀清 刘磊 宋宝刚 杨铁钊 王春军 邱恩建 陈荣平 颜培强
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 烟草 TMV 差异基因表达 cDNA-AFLP
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种种质资源分子遗传学
• 页码范围: 62-70
• 分类号: S435.72
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.00062

摘要

以烤烟品种龙江925[高抗烟草普通花叶病(TMV)]接种TMV的叶片为材料,选用240对引物组合的扩增,获得约9 500个转录基因片段,经过克隆测序最终获得了12个诱导表达片段,它们与核酸代谢、蛋白质合成与修饰、能量代谢、胁迫响应、细胞内运输、糖代谢等相关.利用荧光定量PCR分析诱导表达片段TIF2在0～72 h之间5个时间点(0、12、24、48和72 h)的基因差异表达,证实了所获得的基因序列为真实诱导的表达序列.对此序列进行RACE,最终获得全长cDNA序列,全序列857 bp,预测的编码区在101～613 bp之间,共编码170个氨基酸.经Blastn、Blastp比对分析,在烟草中没有获得其同源序列,确定该基因是在烟草中发现的与抗TMV相关的新基因.