草原樱桃PGIP基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 于文全 刘海荣 杨晓华 赵恒田
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 草原樱桃 PGIP基因 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 页码范围: 38-42
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 2930字
• 语种: 中文

摘要

为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析.以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段.序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990 bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列,GenBank登录号为GU068977；该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95％～99％.系统进化分析显示,属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点.克隆了草原樱桃PGIP基因,为樱桃抗病育种提供一条新的基因资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨晓华		41	85	5.0	7.0
2	赵恒田	中国科学院东北地理与农业生态研究所	36	254	10.0	15.0
3	刘海荣		26	41	3.0	4.0
4	于文全		21	47	4.0	5.0