星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较

• 作者: 申欣
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 星虫动物 线粒体基因组 基因排列 分子标记
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 554-559
• 分类号: Q959.197
• 字数: 4662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1111.2012.09.010

摘要

综合利用通用引物PCR和长PCR扩增,获得可口革囊星虫的线粒体DNA,结合鸟枪法和引物步移法获得可口革囊星虫的线粒体基因组.比较可口革囊星虫与方格星虫线粒体基因组,所有的37个基因均在同一条链上编码.2个星虫动物线粒体基因组蛋白质编码基因的起始、终止密码子及氨基酸长度存在差异.2个星虫动物的线粒体基因组,存在6个保守的基因区块:(1) nad6-cob-P-S2-C-M,(2) I-K-nad3-F,(3) nad4L-nad4-L2,(4) nad1-W-atp6,(5) nad5-S1及(6) nad2-cox1.去除转运RNA而仅比较蛋白质编码基因和核糖体RNA,则2个星虫动物线粒体基因组主编码基因的基因排列完全一致,均为:cox1-cox2-atp8-cox3-nad6-cob-srRNA-1rRNA-nad3-nad4L-nad4-nad1-atp6-nad5-nad2.星虫动物、环节动物和螠虫动物线粒体基因组共有5个保守区块:(1) cox1-cox2-atp8,(2)nad4L-nad4,(3) srRNA-1rRNA,(4) cox3-nad6-cob,(5) atp6-nad5.在15个主编码基因中,nad5基因和nad4基因变异位点数最多,因此可作为备选的分子标记,用于分析星虫动物不同物种和群体之间的生物多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院	37	175	8.0	11.0