马铃薯抗晚疫病基因Rpi-blb2的LRR 区域多态性及分子进化分析

• 作者: 戚金亮 杨永华 游录鹏 苗婧 邹爱兰
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯晚疫病 Rpi-blb2 LRR区域 多态性
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 485-494
• 分类号: S532
• 字数: 5232字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2012.00485

摘要

马铃薯抗晚疫病基因Rpi-blb2 是来源于马铃薯野生种Solanum bulbocastanum 中的一个具有广谱抗性的NBS-LRR 类抗病基因.文章用PCR 的方法从20 个高抗晚疫病的马铃薯栽培种和20 个高感晚疫病的马铃薯栽培种以及7 个马铃薯野生种中克隆了Rpi-blb2 基因的 LRR 区段.采用生物信息学方法对这些序列的相似性、多态性位点、核酸多样性指数等参数进行了分析,发现Rpi-blb2 的LRR 区域在核酸水平上变异程度很高,而且存在多处热点突变位点;通过对该区域的Ka/Ks 值进行估算,发现Rpi-blb2 的LRR 区域总体上受到纯化选择,功能保守,但是LRR 区域的不同部位所受到的选择压力却不尽相同.同时,从核酸水平来看,Rpi-blb2 基因的LRR 区域在马铃薯栽培种和马铃薯野生种之间没有发现明显的分化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨永华	南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室	43	1074	16.0	32.0
2	戚金亮	南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室	11	189	8.0	11.0
3	游录鹏	南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室	1	8	1.0	1.0
4	苗婧	南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室	1	8	1.0	1.0
5	邹爱兰	南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室	2	8	1.0	2.0