韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析

• 作者: 华俊雅 史利利 杨宇 隗洋洋 韦传宝
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 农学
• 关键词: 韭葱黄条病毒 洋葱黄矮病毒 胡葱黄条病毒 CP基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理学与分子生物学
• 页码范围: 231-237,172
• 分类号: S436.421
• 字数: 3643字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3142.2012.02.017

摘要

设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序.分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系.结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%～84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%～90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%～94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小.进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦传宝	皖西学院生物与制药工程学院	78	287	9.0	12.0
5	杨宇	皖西学院生物与制药工程学院	6	17	3.0	3.0
6	华俊雅	皖西学院生物与制药工程学院	4	8	2.0	2.0
7	隗洋洋	皖西学院生物与制药工程学院	3	6	2.0	2.0
8	史利利	皖西学院生物与制药工程学院	1	3	1.0	1.0