犬弓首蛔虫雄虫cDNA文库构建及EST分析

• 作者: 周琪 周荣琼 王德恒 陈昱鸣 马光旭 魏志鹏
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 犬弓首蛔虫 雄虫 cDNA文库 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 609-614
• 分类号: S852.73
• 字数: 4352字
• 语种: 中文

摘要

为构建T.canis雄虫cDNA文库,采用Trizol法提取T.canis雄虫的总RNA,合成cDNA,连接到λTripEx2载体上,通过包装蛋白对连接产物的包装,接种到大肠杆菌XL-1-Blue中进行原始文库和扩增文库的滴度测定.经质量鉴定表明:初始文库的滴度为5.25×106 pfu·mL-1,扩增后文库的滴度为6.90×109 pfu ·mL-1.文库的插入片段大小在500～2 000 bp,平均片段大小为1 000 bp,重组率为99.47％.所有指标均显示已成功构建了T.canis雄虫的cDNA文库.利用该文库获得了189条5'有效表达序列标签(EST).对ESTs拼接后代表了101个Unigenes,含有27个Contigs和74个Singletons.其Unigenes在GenBank中的序列号为HO348195～HO348295.同源性分析检索到有56个Unigenes与已知基因同源,其中具有已知或推测功能的基因有40个,未知功能基因有16个,未比对上的基因45个.未比对上的基因与NR数据库中的蛋白序列没有任何意义的匹配,为研究中发现的新基因.这些结果为进一步开展犬弓首蛔虫功能基因及分子机制研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周琪	西南大学荣昌校区动物医学系	34	171	9.0	12.0
2	周荣琼	西南大学荣昌校区动物医学系	36	128	7.0	10.0
3	马光旭	西南大学荣昌校区动物医学系	7	7	2.0	2.0
4	魏志鹏	西南大学荣昌校区动物医学系	2	1	1.0	1.0
5	王德恒	西南大学荣昌校区动物医学系	1	1	1.0	1.0
6	陈昱鸣	西南大学荣昌校区动物医学系	1	1	1.0	1.0