牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 丁学智 刘建 刘文博 包鹏甲 吴晓云 梁春年 裴杰 褚敏 郭宪 金帅 阎萍 齐社宁
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牦牛 HORMAD1基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 95-100
• 页数: 6页
• 字数: 4656字
• 语种: 中文

摘要

利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析.结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸；其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点.二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主.HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性.