鉴别结核分枝杆菌复合群的新型核酸扩增检测靶标评价

• 作者: 王洁 秦莲花 胡忠义 赵英伟 郭琪 闫丽萍 陆俊梅 马慧 高诗会
• 来源期刊: 中华结核和呼吸杂志
• 关键词: 分枝杆菌属 核酸扩增技术 简单序列重复区间分型
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 907-910
• 页数: 4页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1001-0939.2012.12.007

摘要

目的 寻找新的鉴别诊断MTB复合群(MTC)高特异度和敏感的核酸靶标.方法 利用简单序列重复区间(ISSR)分型技术平台筛选MTC的特征片段,克隆测序获得特征序列并进行序列同源性分析,以该序列为基础设计MTC特征引物,并对211株分枝杆菌菌株(其中MTC107株、非结核分枝杆菌104株)进行鉴别检测.利用分枝杆菌属特征序列16s rRNA和MTC特征序列IS6110的鉴别结果,对MTC特征引物检测结果进行评估.结果 通过ISSR分型获得588 bp的MTC特征片段,该序列为MTC菌株的特征序列,位于MTB标准株H37Rv基因组的315947 ～316534位,以该序列为基础设计MTC鉴别引物MTCF/R,16s rRNA基因在211株分枝杆菌菌株中的扩增结果均为阳性,IS6110序列在107株MTC菌株中扩增阳性率为99％(106/107),在104株NTM菌株中阴性检出率为100％ (104/104),MTCF/R引物在MTC菌株中的扩增阳性率为100％(107/107),在非结核分枝杆菌菌株中的阴性检出率为100％ (104/104).结论 通过ISSR分型技术筛选出的MTC特征序列可作为新的核酸扩增靶标用于MTC和非结核分枝杆菌的鉴别诊断.