辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析

• 作者: 刘峰 王运生 田雪亮 茆振川 谢丙炎 邹学校
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 转录组 EST-SSR
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 168-174
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文

摘要

利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes（97-3Mb）中筛选得到17319个SSR位点（7．83％），其发生频率为1／56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型，占总SSR的56．30％；其次是二、三核苷酸重复基序，其出现频率分别为19．16％和23．18％。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测，获得1538对E．PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证，其中7对（36．84％）在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性，PIC值范围为0．33-0．89，平均为0．67，将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹学校	湖南省农业科学院蔬菜研究所	78	907	18.0	27.0
2	谢丙炎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	175	3639	30.0	51.0
3	茆振川	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	40	564	12.0	22.0