高粱全基因组内含子标记的开发

• 作者: 刘海岚
• 来源期刊: 核农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 内含子标记 SSR标记 遗传连锁图谱
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1101-1105
• 分类号: S513
• 语种: 中文

摘要

通过分析已公布的658个随机挑选的SSR标记在12个高粱属材料中的多态性信息,发现基因中内含子标记较非内含子标记有更高的多态性,因此,本研究利用生物信息学方法进行了高粱全基因组内含子标记的开发。首先,对高粱29448条CDS序列进行内含子位点挖掘,找到115545个内含子位点。其次,在内含子两侧的序列上设计引物,经e-PCR在高粱基因组上筛选及定位,共获得82742个单拷贝内含子标记。其在染色体上数量变异范围为3794个（5号染色体）～15371个（1号染色体）之间,平均每条染色体上8237个。此外还构建了1个公共数据库（www.sicau.edu.cn/web/yms/sip/SIP.html）,以便研究人员下载及使用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘海岚		1	2	1.0	1.0