千里光全长cDNA文库的构建及分析

• 作者: 平军娇 张珍 汤贤春 蔡振锋 钱刚
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 千里光 全长cDNA文库 SMART EST 基因组学
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 557-561
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文

摘要

目的 构建千里光全长cDNA文库,以期研究千里光的功能基因组学信息,为克隆药理学性状相关的功能基因提供数据资源.方法 Trizol法提取千里光叶片总RNA,通过SMART(switching mechanism at 5’end of RNA transcript)构建全长cDNA文库,随机挑取600个单克隆测序分析文库滴度、全长率及冗余率,得到的EST序列进行Blast分析(NR、NT、Swiss-Prot、KEGG)及COG功能分类.结果 文库的库容为4.3×106 cfu/mL,插入片段大小平均1.7 kb,文库重组率96.35％,全长率58.24％,冗余率10.88％;获得524条全长EST序列,含有467条独立基因(unigenes),其中5条序列与千里光次生代谢产物的合成、运输与代谢有关.结论 经检测,SMART技术成功构建了千里光全长cDNA文库,该文库可用于千里光功能基因组鉴定、新基因筛选及次生代谢产物生物合成的表达调控研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱刚	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	49	200	8.0	10.0
2	平军娇	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	9	45	4.0	6.0
3	张珍	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	8	45	4.0	6.0
4	汤贤春	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	27	85	4.0	8.0
5	蔡振锋	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	5	28	3.0	5.0