利用等位基因特异性PCR检测水稻可溶性淀粉合酶基因的单核苷酸多态性

• 作者: 傅军如 彭小松 朱昌兰 林华 欧阳林娟 贺晓鹏 贺浩华 陈小荣
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 可溶性淀粉合酶基因 等位基因特异性PCR(AS-PCR) 单核苷酸多态性(SNP)
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 1080-1085
• 页数: 6页
• 分类号: S511.032
• 字数: 2961字
• 语种: 中文

摘要

单核苷酸多态性(SNP)广泛分布于水稻基因组中,SNP分型已成为水稻遗传作图、关联分析、资源鉴定和分子标记辅助选择等研究的重要技术.本文选择水稻可溶性淀粉合酶基因SSⅢa的12个SNP位点,研究了利用等位基因特异性PCR法检测SNP的可行性.按照等位基因特异性PCR原理设计引物3'末端碱基,并根据每个SNP位点引物3'端的错配类型,在上游引物3'末端第3位引入不同的错配碱基,结果均获得了很好的扩增特异性,PCR检测结果与测序结果吻合.表明,等位基因特异性PCR是一种简便、快捷、可靠和低成本的SNP分型方法,可有效应用于水稻可溶性淀粉合酶基因的种质资源鉴定和分子标记辅助选择育种等相关研究.