新疆红井子盐碱土壤非培养放线菌多样性

• 作者: 关统伟 夏占峰 孙红专 张利莉 贺江舟 贾晓宇
• 来源期刊: 微生物学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 红井子 盐碱土 放线菌多样性 系统发育 免培养方法
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 环境微生物与环境工程
• 页码范围: 606-613
• 分类号: S718.54
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究新疆红井子盐碱土壤中的放线菌物种多样性.[方法]应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法进行放线菌物种多样性分析.利用放线菌特异性引物,以土壤样品总DNA为模板,扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库,并对文库中的插入序列进行RFLP分析.[结果]随机挑选的246个阳性克隆通过酶切筛选出61个不同图谱的重组克隆并测序.分析结果显示这61个克隆序列分属于42个OTUs,分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae);该环境中有71.4％的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97％,代表着放线菌新类群,其中部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表更高级的新分类单元.[结论]红井子土壤中的放线菌组成具有丰富的多样性,并有新放线菌分类单位的潜在资源,值得进一步进行开发研究.