畜禽保种群体遗传多样性的模拟

• 作者: 史利华 吴克亮 王茜 鲁云风 黄文波
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 遗传多样性 保种 畜禽品种资源 计算机模拟
• 年，卷（期）: 2012,（18）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 3849-3858
• 分类号: S813
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.18.018

摘要

[目的]基于微卫星标记特点,采用计算机模拟技术,探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程.[方法]选择30个均匀分布于基因组、具有4-10个等位基因的标记位点,位点间无相互作用；模拟产生的畜禽保种群公母比例为1∶5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代间无重叠,群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200,保种繁殖50个世代,1 000次重复.采用多态性位点数(num-p)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ae)、观测基因杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、稀有等位基因数(RA)、缺乏丰富位点数( NRP)作为遗传多样性度量指标.[结果]保种群体的遗传多样性总体趋势随保种世代而逐渐降低,不同群体规模遗传多样性的降低速度差异显著,相比基础群,Ne值越大,num-p、Na、Ae、Ho、He和RA的下降速率越慢,且当Ne=100和200时,num-p基本维持50个世代不变,RA则分别增加0.86％和2.49倍；而Ne值越大,NRP的增加速率越慢.[结论]遗传漂变导致了群体内遗传多样性的丢失.小群体中遗传漂变导致的遗传多样性丢失速度比大群体更高,发生在闭锁群体水平上的有效群体规模的减少将加快基因漂变速度,从而降低保种群体内的遗传多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲁云风	中国农业大学动物科学技术学院	67	231	9.0	11.0
5	吴克亮	中国农业大学动物科学技术学院	25	170	7.0	12.0
6	王茜	中国农业大学动物科学技术学院	31	297	9.0	17.0
7	黄文波	中国农业大学动物科学技术学院	2	8	1.0	2.0
8	史利华	中国农业大学动物科学技术学院	2	26	2.0	2.0