龙眼胚性愈伤组织NBS-LRR类抗性基因的同源克隆及序列分析

• 作者: 叶炜 林玉玲 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: NBS 抗性基因 龙眼 胚性愈伤组织
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2206-2213
• 页数: 8页
• 分类号: S667.2
• 字数: 6472字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.12.017

摘要

以龙眼胚性愈伤组织cDNA为材料进行龙眼抗性基因同源克隆(RGA).结果表明:在51个阳性克隆中有29条没有重复的序列与已知抗性基因具有同源性.经多重序列对比发现,29条序列均发现典型的NBS结构,其中26条序列具有完整的NBS结构域基序,包括p-Loop/Kinase-1a[GGV (I/M) GKTT],kinase-2[LVDDVW(D)],kinase3a (GSRⅢTTRD)以及一个疏水的[GL(F)PL(F)AL];3条序列表现为截断的NBS序列,其中有2条出现终止信号.进化树分析发现,29条序列可分为明显的2个类群,仅2条序列归为TNL类群,其余27条均为non-TNL类群.non-TNL类群可以进一步分为4个亚类群,non-TNL-1、non-TNL-2类群与毛果杨BED-NBS-LRR (BNL)基因有较高同源性,non-TNL-1类群kinase-2[LLMDGLW]基序在组内保守,但与已知R基因存在较大差异.通过RACE克隆non-TNL-1成员NBS39全长发现,NBS39氨基酸残基序列N-端具有明显的coiled-coil结构,pfam分析具有NBS及LRR8功能域,但不具有BED-finger结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶炜	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	23	109	6.0	9.0
3	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
4	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0