甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析

• 作者: 李杨瑞 杨丽涛 梁潘霞
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 核苷二磷酸激酶 克隆 生物信息学分析 表达
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2199-2205
• 页数: 7页
• 分类号: S566.1
• 字数: 5256字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.12.016

摘要

采用RT-PCR技术克隆了甘蔗核苷二磷酸激酶基因全长cDNA,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为686 bp,包括1个450bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,GenBank登录号为JQ712580.甘蔗与高粱NDPK基因cDNA序列的同源性为96％,氨基酸序列同源性为98％;该基因推导的蛋白分子量大小为16.83 ku,等电点为6.58,疏水性分值在-2.089～2.033;蛋白二级结构中α-螺旋占44.3％,随机卷曲占24.83％,延伸链占20.13％,β-转角只占10.74％.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,NDPK1基因表达均呈先升高后降低的趋势,30h达最大;在处理后的18、30、40h,PEG与PEG+Si处理的NDPK1基因的表达量有显著差异.