基因芯片技术对哮喘病人相关基因的筛选和分析

• 作者: 包振民 张为忠 张伟毅 李靖 王海燕 纪霞 贾少丹 邢明青
• 来源期刊: 临床肺科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 哮喘 外周血 基因芯片 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 6-8
• 分类号: R562.25
• 字数: 3696字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-6663.2012.01.003

摘要

目的 利用基因芯片技术寻找哮喘病患者与正常人外周血单核细胞之间差异表达基因,拟为哮喘的早期诊断及预防提供分子标记.方法 用淋巴细胞分离液分别提取16例哮喘病患者与16例正常人外周血单核细胞,用QIAGEN Rneasy Kit提取纯化样本总RNA,并合成用荧光标记的cRNA,分别与含有41 000条基因序列的全基因芯片杂交,以基因表达倍数值≥2.0和基因表达倍数值≤-2.0为阈值来确定差异表达基因,然后用Genespring软件利用生物信息学方法对差异表达基因进行功能分类分析.结果 按P＜0.05差异显著性标准,从34 183条表达基因谱中,筛选出哮喘患者与正常对照差异表达2倍以上的基因有4177条,差异表达2倍以上已知与哮喘相关的基因有19条.经代谢途径分析发现这些差异基因主要涉及到炎症反应、免疫反应、防御反应、创伤反应、外部刺激反应等8大功能分类.结论 哮喘的发生涉及众多基因表达的改变,芯片技术可以有效地筛选出哮喘患者与正常对照的差异表达基因,对进一步探索哮喘的发病机制、有效的干预或逆转哮喘具有重要意义.