中华鳖3个地理群体线粒体基因D-loop区遗传多样性分析

• 作者: 李彩燕 钱国英 黄雪贞
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华鳖 线粒体DNA D-loop区 遗传多样性 PCR-SSCP
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 17-24
• 分类号: Q347|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27485

摘要

采用PCR结合DNA测序技术和SSCP技术,分析了中华鳖3个地理群体线粒体DNA(mtDNA) D-loop区部分序列的变异及遗传多样性.在25个个体中,其碱基组成为A+T的平均含量(65.4％)高于G+C(34.6％),共检测到变异位点7个(约占总位点数的5.7％),转换/颠换值为2.76.核苷酸多样性(π)为0.019 95,平均核苷酸差异数(K)为2.453.25个个体分属6个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.707,单倍型间的平均遗传距离(P)为0.027.6个单倍型构建的UPGMA系统树聚为3个分支.结果表明,中华鳖群体mtDNA D-loop区序列存在着较丰富的变异和遗传多样性,日本鳖的遗传多样性比黄河鳖和黄沙鳖丰富,黄沙鳖与日本鳖、黄河鳖的遗传距离较远.而且PCR-SSCP可以检测到两种类型的电泳图谱,其中Ⅱ型均为日本鳖,该技术可用于78位TT←→AA颠换变异位点的检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱国英	浙江万里学院生物与环境学院	120	1410	19.0	33.0
2	黄雪贞	上海海洋大学水产与生命学院	3	30	3.0	3.0
6	李彩燕	浙江万里学院生物与环境学院	19	129	7.0	11.0