4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响

• 作者: 吕新 李玥仁 陈丽华
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 土壤微生物 DNA提取 变性梯度凝胶电泳
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 土壤肥料
• 页码范围: 367-372
• 分类号: S154.36
• 字数: 4289字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2012.04.010

摘要

分别应用高盐法、玻璃珠破碎法、冻融法和试剂盒法4种不同土壤微生物DNA提取方法提取水稻稻田土壤微生物DNA,并通过细菌16S rRNA V3区通用引物GC338f-530R和真菌18S rRNA特异性引物NSl-GCFung进行PCR扩增结合变性梯度凝胶电泳(CGGE)分析,对4种DNA提取方法进行评价.结果表明,玻璃珠破碎法和试剂盒法提取的DNA均能满足土壤微生物多样性分析的要求;其中试剂盒方法操作简单,提取的DNA质量较高,但DNA产量较低且成本昂贵；玻璃珠破碎法用时较长,步骤繁琐,DNA产量较高,纯度较低,但对后续PCR扩增和DGGE分析没有明显影响,且成本低廉.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕新	福建省农业科学院中心实验室	18	98	6.0	9.0
3	李玥仁	福建省农业科学院中心实验室	26	177	8.0	12.0
5	陈丽华	福建省农业科学院中心实验室	18	50	5.0	6.0