大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达

• 作者: 冯志娟 徐兆师 李连城 柴守诚 郑炜君 陈明 马有志
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: NF-YB家族 全基因组鉴定 进化 差异表达 启动子
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1570-1582
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.01570

摘要

利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析.利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析.结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类.启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件.各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达.研究结果促进了NF-YB家族基因的功能研究与利用.