溶藻弧菌相关分离株的分子及VITEK鉴定

• 作者: Liswaniso Gadafii 张德民 戴海平 裘琼芬 郭安南 郭静 阎永伟 黄素文
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 溶藻弧菌 16S rDNA toxR pyrH VITEK 2 COMPACT
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 383-390
• 分类号: S917|Q93-331
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27716

摘要

哈维群弧菌是弧菌属的核心菌群,包括溶藻弧菌在内的6个种在表型和遗传型上均十分相似,要准确鉴定各种有一定难度.看家基因的研究及生化鉴定系统的出现为弧菌鉴定提供了多种方法,本文比较了16S rRNA基因、toxR基因和pyrH基因以及VITEK 2 COMPACTGN鉴定卡对溶藻弧菌相关分离株的分辨力.哈维群弧菌基因组内16S rRNA基因是多拷贝的,且拷贝间序列差异大于种间差异,不适用于种的鉴定.单拷贝基因toxR和pyrH序列种内差异均小于种间差异.基于toxR基因相似性比较可清楚地将18个疑似溶藻弧菌分离株和5个参比株归并到4个种；toxR基因系统发育学分析也显示,哈维群弧菌各种独立地聚类分支,且溶藻弧菌种内存在两个明显的聚类分支,说明两个分支的溶藻弧菌具有独立的进化方向.pyrH基因的相似性比较和发育学分析也得到类似的结果,但pyrH基因具有较强的保守性,因而分辨力稍低于toxR基因.VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡在鉴定溶藻弧菌时也有一定的错误率,且鉴定谱较窄.因此,建议在实际应用中采用toxR基因比对作为溶藻弧菌快速鉴定的主要手段,可再选用pyrH基因对鉴定结果进行验证.