米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴晶晶 张卡 洪志宏 陈宏文
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 米曲霉 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 食品科学
• 页码范围: 394-399
• 分类号: S852
• 字数: 3783字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2012.04.015

摘要

采用PCR技术从米曲霉CICC2012菌株基因组中克隆6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd),并利用生物信息学手段对其氨基酸序列、进化树、理化性质、蛋白质结构等进行分析.序列测定和分析结果表明.gnd基因序列长为1 723 bp.包含1个1 551 bp的开放阅读框,编码516个氨基酸;gnd基因编码的6PGDH氨基酸序列与黄曲霉6PGDH基因的同源性为99％,存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有11,2和6个；6PGDH蛋白分子量为57.3 kD,等电点为5.63; gnid基因编码蛋白二级结构α-螺旋区域占44.57％,β-折叠区域占12.79％.无规则卷曲区域占42.64％；氨基酸残基11～195位点为NADP+结合区域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈宏文	华侨大学化工学院生物工程与技术系	33	268	9.0	15.0
2	吴晶晶	华侨大学化工学院生物工程与技术系	4	33	3.0	4.0
3	洪志宏	华侨大学化工学院生物工程与技术系	2	2	1.0	1.0
4	张卡	华侨大学化工学院生物工程与技术系	3	5	2.0	2.0