玛珥湖好氧不产氧光合细菌pufM基因DNA和mRNA的定量及多样性分析

• 作者: 吴灶和 曾永辉 简纪常 陈晓洁 鲁义善
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 湖光岩 玛珥湖 好氧不产氧光合细菌 pufM 多样性 荧光定量PCR 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 环境微生物
• 页码范围: 1560-1572
• 语种: 中文

摘要

[目的]湖光岩玛珥湖是一类特殊的火山口湖,它完全封闭,地质年代久远,尚未受人类活动的剧烈影响,孕育着丰富而特殊的微生物种群.好氧不产氧光合细菌(AAPB)是以其在有氧情况下能行使光合功能而定义的一类专性异养细菌,其生理生态特征独特,进化年代久远,在水生生态系统的上层水体中广泛分布.目前,AAPB在玛珥湖水体中是否有分布仍是未知.[方法]构建和比较夏季湖水1 m、5m、12 m三个水层的总DNA和总RNA的AAPB光合中心合成的关键基因pufM的6个克隆文库,并结合定量PCR技术,分析了不同水层AAPB的分布、系统发育多样性及其在总细菌中的比重.[结果]6个文库覆盖率和稀释曲线显示样本初步揭示了各水层优势AAPB类群的多样性.BLAST核苷酸同源性介于80％-93％;多样性指数表明,湖光岩表层和底层多样性相当,中间层最低,总RNA的多样性高于总DNA.系统发育分析结果表明,OTU21-24所含的序列(占总序列的49.43％)与β-变形细菌的进化距离最接近,是湖光岩玛珥湖的优势AAPB菌群.定量PCR结果显示1m水层中AAPB在总细菌中的比重最高,可达38.06％;而5 m水层中AAPB所占的比重最低,仅为0.85％; 12 m为9.54％.[结论]湖光岩玛珥湖孕育着丰富而多样的AAPB类群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	简纪常	广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室	59	314	8.0	16.0
2	鲁义善	广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室	44	169	7.0	11.0
3	曾永辉	广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室	3	29	3.0	3.0
4	陈晓洁	广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室	1	4	1.0	1.0