菊花SSR-PCR反应体系的建立和优化

• 作者: 李亚慧 董然 黄丛林
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 菊花 SSR标记 正交设计 反应体系优化
• 年，卷（期）: 2012,（13）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 127-131
• 分类号: S682.1+1
• 字数: 3343字
• 语种: 中文

摘要

为快速确定菊花SSR反应体系,利用正交实验设计L16 (45)对菊花基因组SSR-PCR反应体系的5个因素(模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和Taq酶)在4个水平上进行正交设计,筛选出适合菊花的最佳SSR-PCR反应体系,进一步利用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平.结果表明:建立菊花基因组DNA SSR-PCR反应体系为25μL:60 ng模板DNA、2.0mmol/L Mg2+、0.1 mmol/L dNTP、0.3μmol/L引物、1 U Taq酶.并对菊花引物进行梯度退火试验,其最佳退火温度在53.1℃；扩增程序是:95℃预变性5min；32个循环的94℃变性50 s、53.1℃退火50 s、72℃延伸50 s；72℃延伸8 min,4℃保存.该体系的建立为今后菊花SSR分析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董然	吉林农业大学园艺学院	142	880	15.0	21.0
2	李亚慧	吉林农业大学园艺学院	4	31	3.0	4.0
4	黄丛林	北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心	57	710	15.0	24.0