小麦TaPHYA基因亚家族的克隆及表达分析

• 作者: 吴霞 孟凡华 宋梅芳 李秀全 杨丽 杨克诚 杨建平 王霞 马燕斌
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 小麦 光敏色素A 组织特异性 表达分析
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1354-1360
• 分类号: S512.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.01354

摘要

光敏色素是一类与作物农艺性状密切相关的基因家族.本研究克隆了中国春小麦光敏色素TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3基因完整的编码序列,并对它们进行了生物信息学以及转录分析.在NCBI数据库中对其推测的氨基酸序列进行BLAST分析,发现TaPHYA1和TaPHYA3氨基酸序列中包含光敏色素基因完整的功能结构域.系统进化树分析表明,小麦TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3之间进化关系相近,且与单子叶植物玉米、水稻的PHYA聚为一个亚类.另外,TaPHYA的表达丰度具有组织特异性,在茎、叶、穗中表达量分别是根中的1.35、0.34和0.87倍;而在同光质条件下,其表达丰度也具有光质特异性,TaPHYA的总表达量在黑暗和远红光条件下最高,在蓝光条件下次之,而红光和白光条件下最低.该结果为深入研究小麦光敏色素A基因亚家族的功能奠定了基础.