小麦抗赤霉病品种NBS同源序列克隆与分析

• 作者: 马鸿翔 魏芳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: NBS-LRR 抗病基因同源序列 小麦赤霉病
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 128-135
• 分类号: S512.1
• 字数: 4792字
• 语种: 中文

摘要

根据二穗短柄草NBS-LRR类基因的保守序列设计同源引物,以小麦抗赤霉病品种苏麦3号、宁7840和望水白基因组DNA为模板,通过PCR扩增,得到43条序列,其中4条为非编码序列或结构域不完整;39条与植物抗病基因同源,其中的7条内部存在终止密码子,可能是假基因,经过比对分析,其余32条具有连续的开放阅读框和保守结构域,推导的氨基酸序列均具有Kinase-1a、Kinase-2和Kinase-3a及GLPL区等几个保守区,在GenBank中均能找到与之高度同源的其他物种的核酸序列,并且Kinase-2的最后一个氨基酸均为色氨酸(W),属于non-TIR类NBS基因.32条序列可分为4大类,它们之间核苷酸同源性为64％-98％,编码氨基酸同源性为22％-98％.根据序列分析随机设计5对不同基因特异性引物,并利用RT-PCR技术进行表达分析,结果表明,7-1、s-3、s-4和w-2均能表达,说明这些片段可能是功能性抗病基因的部分序列;7-13不表达,再次证明属于假基因.32条序列在之前未被报道过,这些RGA可以作为筛选赤霉病功能性抗病基因的候选序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马鸿翔	江苏省农业科学院农业生物技术研究所	157	1572	21.0	30.0
2	魏芳	江苏省农业科学院农业生物技术研究所	4	25	3.0	4.0