牙鲆肝脏抗菌肽-2基因序列和表达分析

• 作者: 施志仪 李倩 江山 陈晓武
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 肝抗菌肽2 序列分析 同源建模
• 年，卷（期）: 2012,（z1）
• 页码范围: 12-17
• 页数: 6页
• 分类号: Q785|S917
• 字数: 4510字
• 语种: 中文

摘要

抗菌肽是鱼类先天免疫的组成部分,发现新的抗菌肽对于动物抗病机理的研究和寻找新药物有重要意义.经过对GenBank数据库中牙鲆EST文库进行同源比对后,筛选得到一个具有完整编码框的抗菌肽cDNA序列,结果再经过RT-PCR进行验证,命名为LEAP-2,对该序列进行注释,获得序列登录号EU586111.该抗菌肽能编码102个氨基酸的多肽,前28个氨基酸组成信号肽.推测编码蛋白质分子量为11 276.9 u,理论等电点(PI)为9.33.其蛋白质序列与另外9种鱼类的同源抗菌肽序列比较发现,同源性介于38.2％ ～61.7％.其中57至92位氨基酸为高度保守区,是维持其空间结构的主要区域,其中包含有4个保守的半胱氨酸,可能组成2个二硫键.荧光定量PCR分析显示,LEAP-2基因在肝脏中高表达,在牙鲆仔鱼不同发育时期中也有表达,但是表达水平存在明显差异,特别是在变态中期表达量比较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	48	217	9.0	11.0
2	陈晓武	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	19	53	4.0	6.0
3	李倩	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	10	43	4.0	6.0
4	江山	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	4	52	3.0	4.0