摄食不同饵料草鱼肠道菌群PCR-DGGE指纹图谱构建及分子鉴定

• 作者: 余德光 李志斐 毕香梅 王广军 王海英 谢骏 郁二蒙 龚望宝
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼 饵料 肠道细菌 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 179-184
• 分类号: S961.6
• 字数: 4464字
• 语种: 中文

摘要

采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(DGGE)对摄食不同饵料(非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组)的草鱼肠道内容物细菌分析建立指纹图谱,并对主要优势条带进行了切胶克隆和测序.PCR-DGGE指纹图谱初步分析发现,非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组分别产生了19条、16务和15条可以鉴别的条带,且均有2-3条优势菌条带;非膨化饲料组样品和蚕豆组样品的DGGE指纹图谱的相似性系数为53.6％,非膨化饲料组菌群和膨化饲料组的相似性为39.4％.对PCR-DGGE指纹图谱主要条带进一步回收、克隆和测序,结果共得到25条序列,将所得到的序列在NCBI数据库中同源性分析,发现草鱼肠道内容物细菌群落主要为弧菌科、肠杆菌科和气单胞菌属细菌,其中包括14条不可培养细菌.