一种序列相关支持向量机的β桶状跨膜蛋白预测方法

• 作者: 吕强 吴宏杰 唐剑锋 钱培德
• 来源期刊: 计算机科学
• 学科: 工学
• 关键词: 跨膜蛋白 支持向量机 β桶状
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 人工智能
• 页码范围: 252-255
• 分类号: TP305
• 字数: 3580字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-137X.2012.08.055

摘要

膜蛋白是一种具有重要生物功能的蛋白质,根据蛋白质的序列信息预测其是否属于β桶状跨膜蛋白是结构预测与功能分析的重要先导步骤,也是蛋白质预测领域中的一个挑战性问题.针对这两类问题,提取了208条β桶状跨膜蛋白序列的氨基酸位置与理化特征.利用支持向量机(SVM)进行了预测,结果表明二分类精度与相关系数分别达到了88.36％与0.7723.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱培德	苏州大学计算机科学与技术学院	77	844	16.0	25.0
3	吕强	苏州大学计算机科学与技术学院	134	1011	15.0	26.0
5	吴宏杰	苏州大学计算机科学与技术学院	12	35	4.0	4.0
11	唐剑锋	苏州大学计算机科学与技术学院	2	8	2.0	2.0