水稻OsSsr1基因的生物信息学分析、亚细胞定位及其表达模式

• 作者: 刘凤权 常闪闪 张磊 李文奇 肖姗姗 邵敏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 OsSsr1 启动子 亚细胞定位 表达分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 697-702
• 分类号: S511.035.3
• 字数: 4204字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2012.04.002

摘要

为了探明盐敏感相关基因[ OsSsr1(Oryza sativa L.salt-sensitive related gene 1,GenBank登录号为NM_001065574)]的亚细胞定位及在水稻不同组织和各种逆境胁迫下的表达模式,通过生物信息学手段、洋葱表皮亚细胞定位、RiceXPro数据库和Real-time PCR对其进行研究.序列分析表明OsSsr1的开放阅读框为2004 bp,编码一个由667个氨基酸组成并含有5个跨膜区的蛋白质,该蛋白质N端含有一个信号肽；其启动子序列包含TGACG-motif、ABRE、TCA-element和W box等多个与逆境相关的顺式作用元件.GFP融合表达显示,OsSSR1蛋白质定位于细胞膜.RiceXPro数据库中数据分析表明,OsSsr1基因在水稻不同发育期的不同组织中均有表达,在叶中的表达量最高,胚中的表达量最低.Real-time PCR结果表明,OsSsr1表达水平受干旱、高温、高盐、低温、机械伤害、稻瘟病菌、MeJA和ABA的诱导上调.这些结果显示,OsSsr1基因可能在水稻胁迫反应中发挥重要作用.