桃NAC基因家族生物信息学分析

• 作者: 上官凌飞 俞明亮 张彦苹 张春华 马瑞娟
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 桃 NAC基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 406-414
• 分类号: S662.1
• 字数: 4627字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2012.02.031

摘要

NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注.为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组骨架上分布、表达模式、假定蛋白质结构和亚族分类.预测结果显示桃NAC基因家族包含115个假定NAC蛋白质,被分为17个业族,且与拟南芥中NAC家族基因具有一定的相似性；1个NAC基因分布在11号骨架上,其余分布在1～8号基因组骨架上；对一级结构的分析结果显示桃NAC家族蛋白质分子量和氨基酸数目成正相关,绝大多数是亲水氨基酸,各亚族间等电点没有规律；115个蛋白质的二级结构全部以无规则卷曲为主要构成元件,且它们的三级结构大部分相似.在果皮中表达的NAC家族基因数最多,达到75％；在花芽中表达的NAC家族基因数较少,为1％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	上官凌飞	南京农业大学园艺学院	37	426	13.0	20.0
2	马瑞娟	江苏省农业科学院园艺研究所	145	1653	24.0	33.0
3	张彦苹	南京农业大学园艺学院	7	102	6.0	7.0
4	俞明亮	江苏省农业科学院园艺研究所	131	1385	22.0	31.0
5	张春华	江苏省农业科学院园艺研究所	7	45	4.0	6.0