孔雀草试管苗叶片AP1基因的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 刘敏 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 孔雀草 试管苗 AP1基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1778-1783
• 页数: 6页
• 分类号: S681.9
• 字数: 4604字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.10.012

摘要

以孔雀草试管苗叶片为材料,成功克隆了孔雀草AP1基因的cDNA全长,并对其进行了生物信息学分析.AP1基因全长919 bp(GenBank登录号为JX310277),其中5'-UTR 92bp、3'-UTR 149bp、3'端poly (A)尾巴25 bp,开放阅读框为678 bp,编码225个氨基酸.AP1-1可能存在于细胞核中,为亲水蛋白,不含信号肽,共形成4个卷曲螺旋结构;二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在亮氨酸拉链结构和1个MADS-box 区.此蛋白可能发生磷酸化位点的位置有7个.从系统进化树分析表明,该蛋白与甘菊具有较高的亲缘关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	刘敏	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	9	69	4.0	8.0