枳2个F-box基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析

• 作者: 孙欣 宋长年 张演义 王化坤 王西成
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枳 TIR1和F-box 基因克隆 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S666.9|Q78
• 字数: 4000字
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学方法,以拟南芥TIR1和F-box cDNA序列为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索,筛选出柑橘TIR1和F-box基因的cDNA序列,并以枳花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计5′末端和3′末端扩增的特异引物,利用5′RACE和3′RACE技术,分别获得该基因的5′和3′末端,序列拼接后获得枳的TIR1和F-box cDNA全长.分别命名Pt-TIR1和Pt-F-box,大小分别是2048,1695 bp,在GenBank的登录号分别是FJ502240和FJ502241,其分别编码569和468个氨基酸全长.生物信息学分析表明,Pt-TIR1和Pt-F-box的cDNA序列中分别有microRNA393和microRNA394的识别位点,其与其他植物的F-box一样有着高度保守的序列即F-box结构域.构建Pt-TIR1和Pt-F-box亚细胞定位载体35S-GW-GFP-FJ502237/FJ502238,基因枪转化洋葱表皮细胞,暗培养24 h后激光共聚焦显微镜下观察.亚细胞定位结果表明Pt-TIR1和Pt-F-box均定位于细胞核中.转录因子Pt-TIR1和Pt-F-box均具有核定位功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张演义	南京农业大学园艺学院	19	108	6.0	10.0
3	王西成	南京农业大学园艺学院	14	170	8.0	13.0
6	宋长年	南京农业大学园艺学院	40	502	16.0	21.0
7	王化坤		31	260	8.0	15.0
8	孙欣	南京农业大学园艺学院	17	181	10.0	13.0