背瘤丽蚌F型线粒体基因组全序列分析

• 作者: 李家乐 汪桂玲 陈玲
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 背瘤丽蚌 线粒体基因组 序列分析 基因重排
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 页码范围: 2420-2429
• 分类号: Q78|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201109271418

摘要

部分双壳贝类的线粒体遗传方式是特殊的双重单亲遗传方式:F型存在于雌性体细胞组织和性腺中,M型仅存在于雄性个体的性腺中.通过LA-PCR扩增、SHOT-GUN测序、软件拼接获得背瘤丽蚌(Lamprotula leai)F型线粒体基因组全序列.线粒体基因组全长为16530 bp,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA其中包括2个tRNAser和2个tRNALeu,2个SrRNA及27个长度不等的非编码区,最长的两个非编码区分别为969 bp、228 bp.比较分析已登录到GenBank中的淡水蚌类F型线粒体结构特征,结果显示背瘤丽蚌F型A+T含量为60.28％,表现出A+T偏好性,淡水蚌类线粒体基因组长度的差异主要表现为非编码区长度的差异.此外,背瘤丽蚌mtDNA的COⅡ-12S rRNA区域基因排列存在差异,是ND3、tRNAHis、tRNAAAla、tRNASer1、tRNASer2、tRNAGlu、ND2、tRNAMet8个基因发生重排造成.F型线粒体序列构建的系统进化树中,淡水蚌类和海水双壳贝类分别聚为一支.研究结果为进一步研究淡水珍珠蚌的DUI线粒体遗传方式和种质资源保护奠定基础,为双壳贝类mtDNA基因重排提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪桂玲	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	33	196	9.0	12.0
2	陈玲	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	4	18	3.0	4.0