荷包猪一类缺失型SLA-3等位基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 乔翠 张兴会 张文军 张胜 许崇波 郭丹 高凤山
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 荷包猪 SLA-3基因 缺失型 等位基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 87-93
• 分类号: S961.6
• 字数: 5523字
• 语种: 中文

摘要

为研究荷包猪SLA-3基因特征,设计引物克隆了荷包猪SLA-3,经生物信息学软件分析其基因特征.结果显示,所克隆的荷包猪SLA-3基因(暂命名为SLA-3-HB02)碱基序列长度为1 417 bp,其中2-1 054为ORF区,共编码350个氨基酸,在其编码的氨基酸334-344处存在缺失.SLA-3-HB02与其他SLA-3、SLA-2及SLA-1等位基因群的氨基酸同源率分别为87.8％-98.6％、82.8％-87.8％和83.7％-90.0％.分子进化关系分析,SLA-3-HB02与美国的Hanford遗传距离较近;各功能区分析,SLA-3-HB02保留了HLA-A2等的部分功能基因位点,并与HLA-B15和H-2K1有一定的交叉识别位点.同源模建揭示SLA-3-HB02分子与HLA-A2及H-2K1 3D结构相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乔翠	大连大学生物工程学院生物化学和分子生物学实验室	3	38	3.0	3.0
2	许崇波	大连大学生物工程学院生物化学和分子生物学实验室	70	565	12.0	20.0
3	张兴会		33	60	4.0	7.0
4	张文军		10	9	2.0	2.0
5	郭丹		39	82	4.0	7.0
6	张胜		7	14	3.0	3.0
7	高凤山	大连大学生物工程学院生物化学和分子生物学实验室	60	358	10.0	16.0