抗生素抗性基因连锁传播的侧翼保守元件分析

• 作者: 任君 刘建 曹文清 毛大庆 罗义
• 来源期刊: 应用生态学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 抗性基因 实时荧光定量PCR Tail-PCR tetW侧翼序列
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 240-246
• 分类号: X171
• 语种: 中文

摘要

抗生素在医疗、畜牧和水产养殖业的大量使用造成了环境中耐药细菌和抗性基因的日益增加,也加速了抗性基因在环境细菌间的传播扩散.本研究以环境样本直接提取的总DNA为模板,运用热不对称交错PCR (thermal asymmetric interlaced PCR,Tail-PCR)技术直接扩增抗生素抗性基因上下游序列.通过优化Tail-PCR反应程序,单循环同时扩增出tetW基因的多条侧翼序列,包括6条上游序列和9条下游序列.基于序列的生物信息学分析发现,上游包括一段反向重复序列和已知的一段tetW调节肽序列以及一个已知的插入序列,下游包括一个保守的未知序列和一个开放式阅读框架(the open reading frame,ORF)编码甲基转移酶.结果不仅发现了可能协助tetW基因传播的功能元件,也提供了一个未知侧翼序列高效和便捷的研究方法,即采用Tail-PCR技术,一组样品即能便捷获得多条侧翼序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛大庆	沈阳药科大学生命科学与生物制药学院	7	315	5.0	7.0
2	任君	沈阳药科大学生命科学与生物制药学院	2	3	1.0	1.0
3	刘建	沈阳药科大学生命科学与生物制药学院	1	3	1.0	1.0
4	曹文清	沈阳药科大学生命科学与生物制药学院	1	3	1.0	1.0