Her2(+)/Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析

• 作者: 吴钢 姜茂竹 张积仁 曾融 郑燕芳 麦仲伦
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺肿瘤 受体,Her2 小RNA病毒 计算机生物学
• 年，卷（期）: 2012,（33）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 5-8
• 分类号: R737.9
• 字数: 3141字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2012.33.002

摘要

目的 通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路.方法 在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayExpress子数据库开展检索,使用关键词“breast cancer”、“microRNA”进行检索,获取Her2(+ )/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs.利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析.结果 找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路.结论 差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张积仁	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	167	747	12.0	19.0
2	郑燕芳	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	27	103	6.0	8.0
3	曾融	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	8	12	2.0	3.0
4	姜茂竹	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	13	19	2.0	3.0
5	麦仲伦	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	7	17	2.0	3.0
6	吴钢	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	8	29	3.0	5.0