月季花瓣丝氨酸蛋白酶基因RhSep1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘晓娇 崔士超 张华 谢利娟
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 月季 丝氨酸蛋白酶 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 页码范围: 40-46
• 分类号: Q781
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-5382.2012.08.010

摘要

利用RT-PCR技术,从切花月季品种“Samantha”中克隆丝氨酸蛋白酶基因RhSep1.利用生物信息学技术对所得到的丝氨酸蛋白酶RhSep1序列进行结构与功能预测.结果表明:RhSep1基因全长2442 bp,开放阅读框编码769个氨基酸,推定该丝氨酸蛋白酶分子质量为80.48 kD.通过NCBI和MEROPS肽酶数据库等对RhSep1进行Protein Blast,发现RhSep1具有肽酶S8_3家族SA的典型结构域Petidase_S8_3(序列为Tyr-108-Leu-341)和PA_subtilisin_like的结构域(序列为Tyr-348-Ile-474).预测RhSep1可能具有信号肽、明显疏水区和典型跨膜区,同时RhSep1氨基酸序列中存在较多蛋白激酶C和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、豆蔻酰化位点.这些活性位点往往与蛋白的磷酸化、G蛋白相互作用等信号转导事件有关,RhSep1可能存在复杂的蛋白水平调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢利娟		38	243	10.0	13.0
2	张华		12	44	4.0	5.0
3	刘晓娇		1	2	1.0	1.0
4	崔士超	济南盖世农产品物流交易中心有限公司	1	2	1.0	1.0