不同年龄段大连群体菲律宾蛤仔EST-SSR多样性

• 作者: 张国范 张跃环 杨凤 杨霏 虞志飞 闫喜武
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 菲律宾蛤仔 年龄段 SSR 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2012,（15）
• 页码范围: 4673-4681
• 分类号: Q14
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201105150625

摘要

为查明年龄结构对菲律宾蛤仔同一群体内遗传多样的影响,采用14个SSR分子标记对大连石河不同年龄段的野生蛤仔进行了检测.结果表明:不同年龄段(1龄-Age1、2龄-Age2、3龄-Age3)蛤仔均维持着较高的遗传多样性.根据POPGENE 1.31和SPSS16.0统计分析显示,位点Rp- 11、Rp- 12、Rp- 19对3个年龄段蛤仔的等位基因数差异极显著(P＜0.01)；位点Rp-20、Rp-24、Rp-27、Rp-30对其差异显著(P＜0.05)；剩余7个位点表现为差异不显著(P＞0.05).在平均水平上,每位点等位基因数目Na为4.3095,有效等位基因数目Ne为2.3729,多态位点百分数P(％)为14.观察杂合度和期望杂合度都比较高,观察杂合度平均为Ho=0.2335,期望杂合度平均为He=0.5140.而且,Ne和He随年龄的变化表现出Age2 ＞Age3 ＞Age1的趋势.各年龄段蛤仔-Age1、Age2、Age3的平均观察杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.2357、0.2546、0.2159和0.4951、0.5286、0.5184.Age2的遗传多样性指数高于Age1及Age3,遗传分化相对较低.其中,Age1与Age3蛤仔遗传距离最小,D为0.0195,即变异很小；而Age1与Age2遗传距离较大,D为0.0437,变化范围不大(0.0195-0.0437).从遗传一致度的数值上看了3个年龄段蛤仔的遗传相似程度很大,平均为0.9655.Age1与Age3遗传相似程度高达0.9807,而Age1与Age2相似程度较小为0.9572.说明不同年龄段蛤仔相似程度非常高.根据不同年龄段蛤仔的遗传距离,采用UPGMA平均聚类方法对其进行聚类可知,Age3与Age1蛤仔间遗传距离较小,与Age2蛤仔差异较大.通过对等位基因频率进行卡方检验发现,随着年龄结构的变化,部分基因基因频率减小；同时随着年龄的增长,有部分等位基因得到了纯化.大连群体蛤仔总的遗传分化较低,其遗传分化指数Fst为0.0248(Fst＜0.05),遗传分化系数为0.02,说明总的遗传变异中有2％来自于不同年龄段的蛤仔之间.遗传距离和遗传一致度均值分别为0.035和0.9655,基因流(Nm=9.8238)相对流畅,进一步表明年龄结构对蛤仔种群内遗传分化的影响较小.