刺五加ATP合酶β亚基基因的克隆与序列分析

• 作者: 何闪 曹蕾 梁能松 邢朝斌 陈龙
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 刺五加 ATP合酶β亚基 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 646-647,654
• 分类号: S188+.1
• 字数: 2919字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.02.007

摘要

[目的]克隆刺五加叶绿体的ATP合酶β亚基cDNA并对其进行生物信息学分析.[方法]根据已知物种叶绿体ATP合酶β亚基基因的序列,设计1对同源引物,通过RT-PCR扩增得到刺五加ATP合酶β亚基cDNA,并对其进行序列比对及结构预测分析.[结果] RT-PCR扩增获得了长1 099 bp的刺五加ATP合酶β亚基cDNA,该基因编码366个氨基酸.序列比对及结构预测分析表明,刺五加ATP合酶β亚基基因编码的氨基酸与水稻的同源性最高,达96.41％.其二级结构中含有171个α螺旋(alpha helix),占46.72％；53个延伸链( extended strand),占14.48％;27个β折叠(beta turn),占7.38％；115个无规则蜷曲(random coil),占31.42％.第262 ～271位氨基酸为ATP合酶β亚基的标志性位点.整个多肽链无明显的疏水区域,初步认定为亲水性蛋白.[结论]该试验克隆得到的ATP合酶β亚基基因为叶绿体ATP合酶β亚基基因,为研究刺五加能量代谢对植物次生代谢的影响及了解植物ATP合酶的结构与功能提供了必要的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹蕾	河北联合大学生命科学学院	13	51	4.0	6.0
2	邢朝斌	河北联合大学生命科学学院	56	376	11.0	16.0
3	陈龙	河北联合大学生命科学学院	11	93	4.0	9.0
4	梁能松	河北联合大学生命科学学院	14	173	7.0	13.0
5	何闪	河北联合大学生命科学学院	25	247	9.0	15.0