基于三角褐指藻全基因组假基因的识别及相关生物信息学分析

• 作者: 刘文岭 潘光华 王广策 纪长绵 黄爱优
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 三角褐指藻 假基因 假基因片段 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（33）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 3139-3146
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11434-012-5174-3

摘要

假基因是与功能基因序列相似,但不能表达为功能蛋白质的DNA序列.识别和注释假基因是认识基因组的结构功能的关键.三角褐指藻属于海洋硅藻,富含不饱和脂肪酸,目前其全基因组信息已经解析.为了识别三角褐指藻基因组中的假基因,本研究采用生物信息学的方法构建了从三角褐指藻的基因组中寻找假基因的流程,得到1654条加工假基因、714条非加工假基因和4729条假基因片段.结果表明,尽管三角褐指藻属于低等光合生物,其基因组中存在较多假基因及假基因片段.